החלה את דרכה בקולנוע בשנות ה-80' כשחקנית וב - 1993 ביימה את סרטה הראשון שזכה בפרס ז'אן ויגו היוקרתי. לאחר מכן ביימה עוד שלושה סרטים, אך הפריצה הגדולה שלה הגיעה עם סרטה "ניקוי יבש" בשנת 1999, בכיכובם של מיו מיו ושארל ברלין, שגרף תשבוחות בפסטיבלים ברחבי העולם ואת פרס התסריט הטוב ביותר בפסטיבל ונציה 1999.
"איך הרגתי את אבא שלי" הוא סרטה השביעי והוא זה שביסס את מעמדה כאחת הבמאיות הצרפתיות החשובות ביותר שעובדות כיום. פונטיין סיימה לביים לאחרונה את סרטה "נטלי" בכיכובם של ג'ראר דפרדייה , פאני ארדן ועמנואל ביאר.