"תשע נשמות" הוא סרט פנטזיה לכל המשפחה על אב המשפחה המוצא את עצמו לכוד בגופו של חתול המחמד של המשפחה.
טום ברנד (קווין ספייסי) הוא מיליארדר נועז וממזרי אשר הגיע הכי גבוה שניתן בתחומו. החברה בבעלותו עומדת להשלים הישג עצום - גורד השחקים הגבוה ביותר בחצי הכדור הצפוני. אבל אורח החיים המכור לעבודה של טום ניתק אותו ממשפחתו, במיוחד מאשתו היפה לארה (ג'ניפר גארנר ) ומבתו המעריצה אותו רבקה (מלינה וייסמן).
לכבוד יום ההולדת ה -11 של רבקה היא מבקשת את המתנה שהיא מבקשת בכל שנה - חתול. טום שונא חתולים, אבל הוא נותר ללא מתנה ליום הולדתה של בתו ובצעד נואש הוא מגיע לחנות לחיות מחמד מיסטית המלאה בחתולים יוצאי דופן ואקזוטיים.
בעל החנות, פליקס פרקינס (כריסטופר ווקן), מראה לו חתול מיוחד, ובדרך למסיבה של בתו, טום עובר תאונה איומה. כשהוא שב להכרתו הוא מגלה כי איכשהו, הוא כעת לכוד בתוך הגוף של החתול, שאומץ על ידי משפחתו.
כחיית המחמד של המשפחה וכחתול, טום מתחיל לראות את משפחתו וחייו בפרספקטיבה חדשה ומפתיע. בו זמנית משפחתו מתרגלת לחיים עם חתול מוזר ועקשן ובנו, דיויד, מתגייס לדאוג למשפחתו בדרכים שטום לא ציפה להן.
על מנת שטום יוכל לחזור למשפחתו כאבא וכבעל לו הם ראויים, הוא צריך להבין מדוע נקלע למצב המוזר הזה ויאלץ להתאמץ על מנת לזכות שוב בקיומו כבן אדם.
