"משימה סוף" הוא קומדיית פעולה על בני נוער יתומים אשר חונכו להיות הדור הבא של המתנקשים.
מאז שהתייתמה מהוריה, עוברת מייגן (היילי סטיינפלד) תכנית הכשרה סודית המגדלת את הדור הבא של המתנקשים בחסות הממשלה, תחת המפקד הארדמן (סמואל ל. ג'קסון). מגיל צעיר היא לומדת לנתק את עצמה רגשית ולהיות מפוקסת בהכשרה האינטנסיבית להפיכתה למכונת לחימה. אבל מייגן לא רוצה בעתיד הלוחמני המזהיר שמנבאים לה. היא רוצה לרקוד, להנות, לבלות, להכיר אנשים רגילים ולחוות אהבה.
היא מצליחה לברוח ומשתלבת בסיפור כיסוי של משלחת חילופי סטודנטים. שם, לראשונה, היא נחשפת לכל מה שנערה צעירה בגילה כבר יודעת ומתחילה ללמוד את עקרונות החיים הרגילים, שכוללים מסיבות, בילויים, ריקודים ומשיכת תשומת לב מהבחור אותו היא מחבבת. אולם בזמן שהיא מתמודדת עם המציאות החדשה ונכנסת למשולש רומנטי מסחרר, העבר שלה חוזר ולתמונה נכנסת היריבה הנצחית שלה, ויקטוריה נוקס (ג'סיקה אלבה), שרוצה לנקום בה והופכת את הסיפור למסובך מידי עבור נערה אחת.
