מה אם המלחמה הזו הייתה מסתיימת מחר? לא שווה להלחם בשביל זה? לא שווה למות בשביל זה?
תומאס "נאו" אנדרסון (קיאנו ריבס) החליט החלטה גורלית כשהוא בחר לשאול את השאלה אותה מורפיאוס (לורנס פישבורן) וטריניטי (קארי אן מוס) שאלו אותו קודם. לחפש ולקבל את האמת. לשחרר את מוחו מהמטריקס.
הכל מתחיל בבחירה.
עכשיו, בפרק השני בטרילוגיית המטריקס, נאו לומד לשלוט בכוחותיו הבלתי רגילים בזמן שציון נמצאת תחת מצור של צבא מכונות. רק שעות ספורות מפרידות בין האדם האחרון על כדור הארץ, לרבע מיליון זקיפים המתוכנתים להשמיד את האנושות. אבל אזרחי ציון מעודדים מאמונתו של מורפיאוס ש"האחד" ימלא את נבואת האורקל ויסיים את המלחמה עם המכונות. עכשיו כל התקוות מתגלמות בנאו, שמוצא את עצמו מוטרד על ידי חזיונות מטרידים בזמן שהוא מחפש את הדרך לפעול.
אנחנו אף פעם לא יכולים לראות דרך בחירה, אותה אין אנו מבינים.
מחוזקים בידי אהבתם זה לזו והאמונה בעצמם, נאו וטריניטי בוחרים לחזור למטריקס יחד עם מורפיאוס, ולשחרר את מגוון הכוחות המיוחדים והנשק שלהם במלחמה נגד כוחות הכיבוש והניצול. אך בתוך המטריקס עדיין פועלים כוחות רבי עוצמה המתחמקים מזכות הבחירה ומהאחריות הגלומה בה, בזמן שהם חיים על אמיתות אמוציונאליות של אחרים.
בחירה היא אשליה הנוצרת בין בעלי הכוח לחסרי הכוח.
בינתיים, ישנם גולים כמו הסוכן סמית (הוגו וויבינג), שהקשר הנחרץ שלו לנאו, גורם לו לסרב לפקודות המערכת שקוראת למחיקתו. כשהוא מונע על ידי האנושיות אותה הוא כל כך תעב, סמית יכלה את כל שבדרכו בחיפוש אחרי הנקמה.
מה רוצים כל האנשים בעלי הכוח? עוד כוח.
במסע הבוגדני לעבר תובנות נוספות במבנה המטריקס, ובתפקיד המרכזי שהוא משחק בגורלו של המין האנושי, נאו יתעמת מול התנגדות אדירה, אמת אדירה עוד יותר ובחירה בלתי אפשרית שהוא לא העז להעלות על דעתו.
לא באת הנה על מנת לבחור. כבר עשית את הבחירה. אתה כאן בכדי לנסות להבין למה בחרת כך.
בהתמזגות בין אהבה ואמת, אמונה וידע, מטרה וסיבה, נאו חייב ללכת בדרך אותה הוא בחר. "מה אם לא אצליח?" הוא שואל. "מה אם אכשל?"
אז ציון תיפול.
