"מתנקש אמריקאי " הסרט עוקב אחר עלייתו של מיטש ראפ (דילן או'בראין), מגויס סי.אי.איי הנמצא תחת הכשרתו של סטן הארלי (מייקל קיטון), איש צבא ותיק אשר לחם במלחמה הקרה. הזוג מגויס ע"י סגן איירין קנדי כדי לחקור גל של התקפות אקראיות לכאורה על מטרות צבאיות ואזרחיות כאחד.
יחד, מגלים השלושה, דפוס חוזר על עצמו באלימות המוביל אותם למשימה משותפת עם סוכן טורקי קטלני על מנת לעצור את המפעיל המסתורי המתכנן לגרום להתפרצות מלחמת עולם במזרח התיכון.