"קוד פרוץ" הוא מותחן פעולה אודות סוכן מבצעים מיוחדים ב-CIA המקבל הזדמנות אחרונה להוכיח את עצמו. הוא נשלח למתקן שידור סודי ונידח של הארגון בברטניה, בכדי להגן על מפצחת קודים ומוצא את עצמו במאבק לחים ולמוות.
אמרסון (ג'ון קיוזאק), סוכן מבצעים מיוחדים ב-CIA שמשימתו האחרונה נכשלה וגבתה חיי אדם, מקבל הזדמנות אחרונה בהחלט ונשלח למתקן סודי ומרוחק של הארגון בברטניה, שדרכו נשלחות המשימות לסוכנים פעילים של הארגון בצורה של קוד מוצפן.
משימתו של אמרסון פשוטה לכאורה: להגן על קתרין (מאלין אקרמן), מפצחת קודים צעירה. פיצוצה של מכונית תופת מחוץ לאתר הביון, מבשרת על מתקפה חמושה ומתוכננת היטב וזוג הסוכנים נאלצים להציל את עצמם ואת המידע הרגיש שברשותם ולמצוא מקלט בין מסדרונות הבניין, כשכישורי הלוחמה של אמרסון הינם הנשק היחידי העומד לרשותם.
פיסת מידע, אחר פיסת מידע הנאספות בידי הסוכנים, מערערות את הידוע להם לגבי נאמנותם של הממונים עליהם וחושפות מזימה אפלה. כשהתחנה וסודותיה הכמוסים נמצאים בסכנה, מול אויב חסר רחמים וללא דרך מילוט, השניים מוצאים את עצמם במה שיהפוך למאבק גורלי.
