צרפת תחת הכיבוש של 1942. פיליפה גרבייה, מהנדס אזרחי, הוא אחד ממנהיגי הרזיסטאנס במרסיי. בעקבות מידע שהתקבל מבוגד, הוא נכלא ע"י הגרמנים. "צבא הצללים" מראה באופן ריאליסטי למדי את שגרת חייהם המפחידה והכואבת של אנשי המחתרת הצרפתית. גם ג'וזל קאסל, כותב הספר עליו מבוסס הסרט, וגם הבמאי ז'אן פייר מלביל - הם יוצאי הרזיסטאנס.